Program Studi Magister Manajemen pada jenjang S2 memiliki jalur-jalur konsentrasi yakni Manajemen Pemasaran, Manajemen Keuangan dan Manajemen Sumber Daya Manusia. Di program ini mahasiswa akan mempelajari bagaimana pengelolaan suatu perusahaan sesuai bidang konsentrasi masing-masing, seperti strategi pemasaran suatu produk, atau pengelolaan sumber daya manusia suatu perusahaan dan pengelolaan keuangan di perusahaan. Lulusan Program Studi Magister Manajemen FEB UNTAG umumnya banyak diperlukan lembaga-lembaga pemerintahan atau swasta, diantaranya sebagai konsultan marketing atau konsultan manajemen suatu perusahaan.